Le Lycée Français International de Málaga est un établissement privé conventionné avec l’Agence pour l’Enseignement Français à l’Etranger (A.E.F.E.), elle-même établissement public national à caractère administratif placé sous la tutelle du Ministère des Affaires Etrangères et de la Coopération. L'Agence, qui a été créée par la Loi du 6 Juillet 1990, est représentée à Madrid par les Services Culturels.

Le Lycée Français International de Málaga est dirigé par le Comité de gestion de l’Association pour le développement du Lycée Français International (ADLFI) et par un Chef d’Etablissement (Proviseur), fonctionnaire français nommé par la France.

L’ADLFI comme le Lycée Français International sont à but non lucratif.

Le Lycée Français International de Málaga fonctionne grâce aux subventions de l’A.E.F.E. et aux frais de scolarité payés par les parents.

Le Lycée Français International de Málaga entrant dans le champ d’accords bilatéraux (Convention du 7 février 1969 précisée par celle du 2 juin 1977 - Décret Royal nº 806/93 du 28 mai 1993) entre les états espagnol et français, les élèves bénéficient ainsi d’une validation permanente de leurs études dans les deux systèmes d’enseignement.